获取当前运行的绝对路径 fs.workingDirectory：

var fs = require('fs');
console.log(fs.workingDirectory);

获取当前脚本的绝对路径 fs.absolute()：

var fs = require('fs');
var system = require('system');
console.log(fs.absolute(system.args[0]));  // system.args[0]为当前传入的脚本相对路径

Refer:
http://phantomjs.org/api/fs/property/working-directory.html
http://phantomjs.org/api/fs/method/absolute.html